航运学院是我校具有鲜明特色的学院之一，已有60多年的办学历史。学院前身为1945年11月成立的国立潮汕高级商船学校，开办了船舶驾驶专业。1952年迁至武汉后，成立了武汉河运学校。1979年更名为武汉河运专科学校，开办船舶驾驶专科，1984年又开办了航政管理专科。1992年原武汉河运专科学校与原武汉水运工程学院组建武汉交通科技大学，于1993年开办航海技术(海洋船舶驾驶专业与电信专业合并)本科专业。武汉理工大学成立后，航运学院于2003年申办了海事管理本科专业。航运学院现有航海技术和海事管理两个本科专业。
航运学院主要从事航海类专业教育与培训，下设航海技术系、海事管理系、水上交通安全与环境研究仿真中心、实验中心和船员培训中心。学院对学生实行半军事化管理，现有齐全的航海教育与培训设备与设施，包括全任务大型船舶操纵模拟器、航海雷达模拟器、GMDSS真设备及模拟器、VTS模拟器、各种船用航海仪器、导航设备等，建有一批水上专业训练基地和校外实习基地等。学院拥有交通信息工程与控制专业博士学位、硕士学位授予权，拥有船舶与海洋环境博士学位、硕士学位授予权。近年来，学院承担了多项国家自然科学基金、军工项目和众多的横向科研项目，近三年，院科研经费达11，000余万元。学院在水上安全环境研究、内河航运技术研究和航海仿真技术研究方面占有国内重要地位。
航运学院设有交通信息工程及控制和船舶与海洋环境保护博士点、硕士点。现有教职工83人，其中博导2人，教授10人，副高及以上职称35人，中级职称35人；持证航海专业教师50人，持有甲类一等船长适任证书11人，大副适任证书9人；学院现有教师队伍中博士以上学位15人，硕士以上学位31人。2012年院在读博士生14人、全日制硕士生113人、工程硕士144人，各类硕士生257人，普通本科生1245人，学院本科毕业生供需比1∶3。
现任领导：
职位 姓名 分工 院长 刘敬贤 全面负责学院行政工作；分管人事编制、人才队伍建设、财务、学院发展规划、学科建设、顶岗实践等工作 党委书记 肖耀根 主持党委全面工作；主管党建、保密与稳定工作；分管宣传、工会工作。 副院长 牟军敏 协助院长分管本科理论教学、协助指导学生就业等工作。 副院长 王当利 协助院长分管实验室建设、实践教学、实验实操、非学历船员培训、船员培训中心、黄陂水上训练基地、学生实习船等工作。 副院长 刘克中 协助院长分管研究生教育、科学研究、国际交流与合作、省级重点实验室、工程硕士培养、民生工程等工作。 党委副书记 张干 分管学生工作；分管共青团工作；分管班主任工作；协管党建和稳定工作；协管宣传工作 船员培训中心主任 杨帆 全面负责船员培训工作。
硕士生导师：
职称 姓名 研究方向 陈刚 副教授 陈厚忠 交通环境与安全技术、船舶控 制理论与技术 副教授 陈立家 智能航海与仿真技术 副教授 邓健 水上交通安全与环境，船舶防 污染技术，水路交通数值模拟 副教授 范耀天 交通信息工程及控制 教授 甘浪雄 交通环境与安全保障、海事管理理论与技术、航海控制理论与技术 教授 郭国平 交通环境与安全保障，船舶控制理论与技术 副教授 何正伟 海事信息系统、交通信息工程、海洋环境仿真、溢油应急及防污染 教授 江福才 交通环境与安全保障； 水工建筑工程环境影响评估技术；高等教育研究与管理 副教授 刘成勇 水上交通环境与安全保障、计算机网络应用技术、船舶导航信息系统及数据传输处理 教授 刘克中 交通信息控制与装备、船舶交通安全保障 副教授 马勇 智能海事保障技术、海事无人艇智能路径规划技术 教授 牟军敏 智能航海仿真、水上交通安全 副教授 万红 交通运输工程、交通信息工程及控制、航运与物流管理 教授 王当利 交通环境与安全保障、智能航海与仿真技术 副教授 翁建军 海事管理理论与技术 教授 吴建华 交通信息系统控制、智能航海与仿真 教授 徐言民 智能航海、船舶操纵与避碰、海上作业保障 副教授 徐周华 船舶控制理论与技术、交通环境与安全保障 副教授 杨帆 船舶控制理论与技术 教授 杨星 交通信息工程及控制、船舶与海洋环境保护、航海技术 副教授 张进峰 交通环境与安全保障、海上搜救、船舶气象导航 副教授 庄元 水上交通安全保障及通航安全风险评价
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